바이오나노대학은 나노과학기술을 물리, 화학, 바이오, 생명과학 그리고 식품생명공학 및 영양학 분야에 적용하여 미래사회의 에너지, 전기전자, 재료, 환경, 의료, 식품분야에서 기술적 혁신을 도모하는 전문지식 배양과 인류의 지적자산에 기여할 수 있는 실무 연구능력을 양성하는 데에 교육목표를 둔다. 산업과 과학기술분야의 토대가 되는 창조적이고 폭 넓은 과학기술 인력을 양성함과 동시에 미래형 최첨단 학문의 전문가를 양성하기 위해 본 대학에서는 물리, 화학, 바이오나노, 생명과학 그리고 식품생명공학 및 영양학분야를 바탕으로 융합 교육과정을 구축하고 있다. 나노 기술과 바이오 기술의 융합을 토대로 한 복합과학의 첨단 전문인력을 양성하고자, 내실 있는 이론 강의와 효율적인 실험실습을 진행하고 있으며 학연산 협력체계 및 국내 우수 연구기관과의 연계를 통한 연구중심 대학 시스템을 통해 전문 고급 인력 양성을 목표로 하고 있다.